Trong một lần Phineas, Ferb và Perry đi theo Tiến sĩ Doofenshmirtz qua "Máy-chiều-không-gian-khác", họ khám phá ra một vũ trụ hoàn toàn mới nơi một phiên bản thứ hai và thực sực độc ác của Doofenshmirtz thống trị cả vùng Ba Bang với một đội quân rô-bốt. Để cứu bạn bè mình khỏi tình huống nguy hiểm, Perry đã tiết lộ danh tính bí mật của mình là một đặc vụ bí mật. Phineas và Ferb được giải cứu, gặp mặt phiên bản của họ ở chiều không gian thứ hai và bắt đầu hành trình giải cứu Perry.